Бургас също е представен като град със сериозни екопроблеми в Зелената книга, като основен замърсител за региона е предприятието "Нефтохим". Бургазлии се оплакват и от екопроблемите причинени на Бургаското езеро. По неговата повърхност се образува мазен филм - т.нар. гел, който убива животните под повърхността му. Рано сутрин вредни изпарения във въздуха тровят жителите на града, а проблемът се засилва особено през лятото, установили експерти от неправителствената организация. "В Бургас през нощта няма да намерите отворен прозорец. Случва се да се събуждам и да скоча от страх, че не съм спряла газовия котлон, а да се окаже, че специфичния мирис е защото не съм затворила прозореца", разказала жителка на Бургас на Румен Попов при посещението му в града. Плажната ивица по Южното черноморие се унищожава от незаконни строежи на хотели и увеселителни заведения, нерегламентирано се строят вълноломи, които още повече утежняват водообмена в заливите, се посочва още в Зелената книга.
Бургас е една от 10- те горещи екологични точки в страната. Това се дължи както на дейността на големите предприятия на територията на общината: “ЛУКойл Нефтохим” АД, пристанище Бургас, “Кроношпан” АД и др., но и на натоварения транспортен трафик.
Състоянието на замърсяването на водите на територията на общината също е обезпокоително. В езерото Мандра например се изливат отпадъчните води от “Меден рудник”, които в момента се пречистват само по механичен начин. Част от предприятията на територията на общината директно изсипват отпадните си води в Черно море без да преминават през локални пречиствателни станции.
Проучванията на въздействието на атмосферното замърсяване върху здравния статус на населението установяват неоспорима връзка между атмосферното замърсявания и някои заболявания като: дихателни, нервни, вродени аномалии, усложнения при бременност и др.